Bộ máy tổ chức hiện tại gồm:
I. Lãnh đạo Sở
- Ông Phạm Văn Mạnh, Giám đốc Sở KH&CN.
- Ông Nguyễn Đình Bộ, Phó Giám đốc.
- Ông Lê Lương Thịnh, Phó Giám đốc.
- Ông Lưu Xuân Lâm, Phó Giám đốc Sở
II. Các phòng chức năng và lãnh đạo phòng gồm:
1. Văn phòng Sở
- Ông Vũ Ngọc Dương, Chánh văn phòng
- Ông Đào Quang Hà, Phó Chánh văn Phòng
2. Thanh tra Sở
- Bà Nguyễn Ái Vân, Chánh thanh tra.
- Ông Phạm Ngọc Long, Phó Chánh thanh tra
3. Phòng Quản lý Khoa học
- Bà Vũ Thị Thu Hiền, Trưởng phòng
- Bà Đặng Thị Lan Anh, Phó Trưởng phòng
4. Phòng Quản lý Công nghệ và Sở hữu trí tuệ
- Ông Lê Thanh Hải, Trưởng phòng.
- Ông Lê Tuấn Linh, Phó Trưởng phòng
5. Phòng Kế Hoạch - Tài chính
- Ông Nguyễn Duy Hưng, Trưởng phòng
- Bà Phan Khánh Hiền, Phó Trưởng phòng
6. Phòng Quản lý Tiêu chuẩn - Đo lường - Chất lượng
- Bà Lê Thị Lý, Trưởng phòng
- Bà Nguyễn Thị Yến, Phó Trưởng phòng
III. Các đơn vị trực thuộc Sở
2. Trung tâm Đo lường, thử nghiệm và Thông tin khoa học
- Ông Vũ Văn Tân, Giám đốc
- Ông Lê Duy Thủy, Phó Giám đốc.
3. Trung tâm Ứng dụng khoa học công nghệ và khảo nghiệm giống
- Bà Nguyễn Thị Thủy, Giám đốc
- Ông Bùi Công Hiển, Phó Giám đốc
- Bà Đinh Thị Bình, Phó Giám đốc
